Video slovníček

Technické připomínky, pravidla, podpora fóra, nějaká přání, stížnosti, atd.....

Video slovníček

Příspěvekod Franta » 20 pro 2013 09:32

co to jsou microRNA a jak fungují - včetně mého popisu:
http://www.youtube.com/watch?v=_-9pROnSD-A
Micro RNA exprese
0:10-0:19 transkripce RNA
0:19-0:33 folding RNA
0:36-0:48 mRNA enkóduje bílkovinu - translace
0:48-0:53 microRNA tomu procesu brání
1:00 Vpravo - molekuly Anti-microRNA zvyšují produkci bilkoviny
1:00 Vlevo - bez léčby molekulami Anti-microRNA

SiRNA Video to vysvětlí nejlépe: http://www.youtube.com/watch?v=FiGkE3RnjWY Na videu je vidět jak se injekčně vpraví dsRNA, která je poté bílkovinou jménem Dicer přestřižena na duplexní siRNA. Dále se připojují bílkoviny TRBP a Ago2, které duplexní siRNA rozpletou. Bílkoviny pak navádí siRNA na konkrétní úsek mRNA. siRNA spolu s těmi bílkovinami tvoří RISC (z angl. RNA-induced silencing complex = komplex způsobující umlčení RNA) - bílkoviny se jmenují: dicer, TRBP a Ago. RISC pak způsobuje rozštěpení cílové mRNA. A dochází tak k posttranskripčnímu umlčení (silencingu) daného genu, tzn. gen se sice přepisuje, ale jeho mRNA je následně štěpena, takže kýžený bílkovinný produkt není vytvářen. (zde GRK2)
Uživatelský avatar
Franta
 
Příspěvky: 2423
Registrován: 14 úno 2013 09:47
Bydliště: Jižní čechy

Tool-like receptory - TLR

Příspěvekod Franta » 21 úno 2014 08:46

Tool-like receptory - TLR
http://www.youtube.com/watch?v=JICySIEe ... TtHAmX7JZZ

Co na videu vidíme
obrázek TLR - takto vypadá ve schématu Toll-like receptor.
červenou fixou napsal pán, že známe 10 TLR
0:35 Pak pán nakreslí buněčnou membránu a membránu endozómu
membrány všech 10 typů buněčných TLR receptorů. Funkce desátého TLR je neznámá.
1:14 červenou fixou spojí receptory, které pracují v páru (heterodimery)
1:29 působení patogenů na receptory
******
2:00 nakreslí na nový papír znovu buněčnou membránu a membránu endozomu
3:12 nakreslí působení lipoproteinů, patogenů, RNA virů na tyto receptory
*****
4:07 nový papír - nakreslí jak Lipoproteiny nebo Lipoteichoická kyselina (moje poz. ty jsou součástí bakterií) spojí dohromady párové TLR a spustí kaskádu událostí
vyprodukuje se transkripční faktor NFkB a ten projde až do jádra buňky. Tam se transkripcí vyrobí cytokiny (informační molekuly)
5:19 a tyto cytokiny se dopraví endozomem ven z buňky
****
podrobněji
5:32 znovu nakreslí membránu buňky, párové TLR, kaskádu událostí a vyprodukované transkripční faktory.
NFkB (způsobí vyprodukování prozánětlivých cytokinů)
AP-1 Activator protein 1 - transkripce cytokinů, prozánětlivé cytokiny
IRF interferon regulační faktor (způsobí transkripci interferonů)
****
6:50 nový papír
nakreslí buněčnou membránu a TLR
dále vir, který se dostane do buňky do endozomu, tam se spustí opět přes TLR kaskáda událostí. Vyprodukuje se IRF Interferon regulační faktor a ten se dostane do jádra buňky
7:55 tam se vyprodukují interferony INF-a, INF-b a pomocí endozomu se dostanou ven z buňky. Interferony pak dají vědět ostatním buňkám o hrozícím nebezpečí.
(moje poznámka - interferony, ty co se píchají, se píchají proto aby se imunitní systém zmátl - tj proto aby imunitní systém nebojoval na místech kde imunitní systém u eresky nesprávně bojuje, ale aby bojoval jinde. Proto interferony způsobují chřipkové příznaky)
****
8:58 TL4
reakce receptoru na baktérii.
Aby se na tu baktérii navázal, tak potřebuje protein zvaný MD-2 a také receptor zvaný CD-14, to je normální receptor k zahájení fagocytózy (pohlcení a strávení patogenu buňkou), dále dochází opět ke kaskádě událostí jako viz výše a produkty jsou opět cytokiny, které informují ostatní buňky imunitního systému ke zlepšení reakce na tyto konkrétní baktérie.
Uživatelský avatar
Franta
 
Příspěvky: 2423
Registrován: 14 úno 2013 09:47
Bydliště: Jižní čechy

MHC I a MHC II

Příspěvekod Franta » 21 úno 2014 10:18

MHC molekuly
major histocompatibility complex MHC class I. - Hlavní histokompatibilní komplex MHC třídy 1. - se nacházejí na většině buněk organismu. Jejich funkcí je prezentovat antigenní peptidy z patogenů (nejčastěji virů) CD8+ cytotoxickým T – lymfocytům.


Video:
http://www.youtube.com/watch?v=A5PcjDWnlHY
0:10 nakreslí buněčnou membránu a dva typy MHC. MHC1 a MHC2
MHC1 je charakterizován jednou peptidovou nohou navázanou na fosfor-lipidovou membránu
MHC2 má dvě nohy
0:26 MHC1 se nachází na všech buňkách s jádrem, to znamená že se nenachází na červených krvinkách
MHC2 se nachází pouze na antigen prezentujících buňkách

0:42 MHC1 se nachází na všech buňkách s jádrem, tak jako jsou leukocyty, lymfocyty
lymfocyty jako T-buňky a B-buňky
0:53 Nacházejí se také na fagocytech, tak jako jsou makrofágy
0:57 a také na nervových buňkách zvaných dendrity

1:10 MHC2 se nacházení na antigen prezentujících buňkách, tak jako jsou fagocyty-makrofágy a na dendritických buňkách

1:30 - červený puntík na MHC1 - je antigen. Buňka, která ho prezentuje je už mrtvá
1:34 - nicméně když molekula MHC2 prezentuje antigen, tak prezentuje svůj antigen
to aktivuje T-buňky tj. buněčně-navozenou imunitu - adaptivní imunitní systém

Nový papír - první polovina papíru
1:55 nakreslí buněčné membrány:
APC - antigen prezentující buňku
Cytoxickou T-buňku, NK (nahoře), která zabíjí infikované buňky.
2:10 - stuktura MHC molekuly je docela komplexní
skládá se ze čtyř mikroglobulínů, jeden je označený červeně, který se ve struktuře nikdy nemění
to je MHC1
a horní část se skládá z regionů alfa 1 a alfa 2, které slouží jako štěrbinové vázací místo pro konkrétní antigen
2:35 alfa1, alfa2, alfa 3, beta 2 - doména která zůstává stejná
takže jestliže je tato buňka infikovaná, tak bude prezentovat MHC1
(diskutující přednášejícího opravuje, že MHC1 prezentuje antigen, nejen v době infekce)

2:53 červený puntík - peptid - antigen, který přesně zapadne do komplexů MHC alfa-1,2 a 3
2:58 T-cytoxická buňka má speciální receptor, který se taká skládá z alfa a beta domén
tento receptor se jmenuje CD8, který je specifický pro tento typ cytoxických(zabijáckých) T buněk.
Tento receptor kontroluje, to co je prezentováno na MHC1
Jestli je tam cokoliv prezentováno, tak takto buňka zemře
Buněčně navozená imunita se o zbytek postará - většinou to jsou cytoxické T-buňky

Druhá polovina papíru
3:47 MHC2 se nachází pouze na antigen-prezentujících buňkách neboli na APC a prezentuje svůj antigen na MHC2 T-pomocným buňkám jako je tato
3:56 nakreslí T-pomocnou buňku
4:05 MHC2 má dvě peptidové nohy a opět čtyři mikro-globulinové regiony alfa-1, alfa-2, beta-1, beta-2
na rozdíl od MHC1 jsou tyto regiony v MHC2 nastaveny tak aby do nich zapadl pouze jeden konkrétní antigen
alfa-1 a alfa-2 jsou kompletně jiné struktury než v MHC1, pouze nesou stejné jméno ze stejné skupiny bílkovin.

4:50 takže tato buňka nenese MHC z důvodů, že chce zemřít, nebo protože je infikována, ale protože chce pomoci od T-pomocných buněk
5:10 a jakmile je antigen jako tento prezentován (červený puntík), tak ho zaregistruje receptor na T-pomocných buňkách (Th), který se jmenuje CD4
5:52 a tento receptor má čtyři části d1, d2, d3, d4
d1 a d2 se napojí na molekulu MHC2
a stejně tak jako u receptoru CD8, tak i receptor CD4 zkontroluje jestli MHC molekula se stala MHC prezentující molekulou a jestli je to ok, tak se T-buňka stane aktivovanou a zahájí buněčně-navozenou imunitu s tím, že T-buňky zahájí proliferaci a aktivitu B-buněk

Nový papír:
5:55 Tak jako jsme zmínili dříve s MHC1, toto je cytoxická T-buňka (nahoře)
Jakákoliv infikovaná jaderná buňka. Dejme tomu infikovaný makrofág. (dole)
6:12 toto je MHC1, který jak jsme již zmínili se skládá z domén alfa-1,2,3 a z neměnné domény beta 2, které se reprezentují jako jedna molekula.
6:41 Cytoxická T-buňka má receptor zvaný CD8 který se váže na alfa-3 a kontroluje jestli MHC který začal prezentovat není MHC1, a jestli byla kontrola úspěšná, tj. jestli je to MHC1, tak jiný receptor T-cytoxické buňky skládající se opět z mikroglobulinů alfa a beta zkontroluje antigen - ne přímo, že by kontroloval, ale tento T-receptor má stejný tvar jako MHC molekula na konkrétní antigen a tak se alfa a beta domény liší pro každou T-cytoxickou buňku.
A pokud to do sebe zapadne, tak tato antigen prezentující buňka zemře
Konec MHC2 - přeskakuji, protože se mi to zdá být zřejmé z nákresu.
Uživatelský avatar
Franta
 
Příspěvky: 2423
Registrován: 14 úno 2013 09:47
Bydliště: Jižní čechy


Zpět na O tomto fóru - návody - informace pro začátečníky a ostatní členy fóra

Kdo je online

Uživatelé procházející toto fórum: Žádní registrovaní uživatelé a 2 návštevníků